研究报告

马铃薯MYB转录因子基因的序列分析  

刘旭婷 , 范菠菠 , 张旭婷 , 王鹏伟 , 高慧 , 马艳红 *
内蒙古农业大学农学院, 呼和浩特, 010019
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2018年10月25日    接受日期: 2018年10月31日    发表日期: 2020年02月16日
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摘要

MYB 基因家族是植物中最大的一类转录因子家族,广泛参与植物的生长发育和代谢调控过程。本研究通过生物信息学方法对美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information, NCBI)中筛选的 16 条马铃薯 MYB 基因进行分析,预测其分子量和等电点等理化性质、基序、二级结构和三级结构,并用 MEGA 5.0 与已报道具有明确功能的 20 MYB 蛋白进行多序列比对分析并构建系统进化树。结果表明:马铃薯中筛选出 16 个的 MYB 基因蛋白大小在 104~379 aa,分子量和等电点分别介于 66 877.11~147 918.09 kD 4.95~5.16 之间;基序预测得到 3 个特征基序,最长的基序含 50 个氨基酸;α- 螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构,三级结构中都含有螺旋 - 转角 - 螺旋结构;进化树分析中,其中 StMYB12 SIMYB12 同源性高,StMYBA1StAN1 StMYB113 与矮牵牛 AN2 同源性高,StMYB21 MdMYB1 有同源性,推测马铃薯的 StMYB12StMYBA1StAN2StAN1StMYB113 StMYB21 可能参与花青素合成代谢调控,这为下一步马铃薯花色素苷合成调控相关 MYB 基因功能研究提供参考依据。

关键词
马铃薯(Solanum tuberosum);MYB;转录因子;序列分析

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《分子植物育种》印刷版
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